Действия игры развиваются в Японии,в городе Намимори.Когда Бьякуран был повержен,молодая Вонгола наконец то могла благополучно вернуться в свое время,но кто-то,чья личность пока еще неизвестна,перенастроил машину,и вместе с Цуной и его друзьями в прошлое попали и другие люди.
Как им вернуться в свое время?Да и хотят ли они вернуться?"Машина времени" самоуничтожилась сразу после того,как перенаправила их в прошлое.Пока создадут новую машину,уйдет черт знает сколько времени,и "везунчикам" ничего не остается делать,как пытаться найти тех,кто в этом замешан.
Пока все пыхтят над машиной и своим расследованием,в школу переводятся ученики из семьи Шимон.Они быстро втираются в доверие Тсуне,и только хотят начать действовать,как на горизонте появляется семья de Luca.
Да,семья-предатель.Раньше она была в дружественных отношениях с Вонголой,но это не мешало ей вынашивать свои коварные планы.
Цель этой семьи - захватить мафиозный мир.И что же,она долго скрывала свои силы,развивалась,крепла.Она никогда не выделяла себя,не афишировала,и любой третий на улице мог быть её членом.
Но факт остается фактом,она - сильная угроза для всей мафии.Семья Шимон все еще скрывает свои намерения,но в любой момент может напасть на Вонголу,впившись когтями ей в глотку.Сама же Вонгола пока слепа и наивна к растущей опасности.Она  защищает семью Шимон,а так же готовится к бою с семьей de Luca,пытаясь объединить свои силы с другими мафиозными семьями.Но эти семьи сами-то не лыком шиты! Многие из них преследуют свои цели,не говоря уже о самой Вонголе, чьи некоторые члены не хотят объединятся,или же просто ищут для себя выгоду.
Семья de Luca по силе сильнее Вонголы и Шимон вместе взятых.Каждый день она растет и растет.Таинственная семья действует всегда скрыто,а её члены преимущественно для всех загадка.Очень большая возможность,что все те люди,что тебя окружают и есть твои враги!Кому тогда верить?Тот с кем ты всегда так мило общаешься,возможно завтра воткнет тебе нож в спину!
Вот такие проблемы нависли над бедной Вонголой.Но это еще не все!Бьякуран жив,и многие из его семьи попали в прошлое.Что же он будет делать?Тоже присоединится к Вонголе?А может он и есть та семья?
Очень много вопросов и так мало ответов.Может,найдем их вместе?)